創薬シード化合物探索基盤ユニットハイスループットスクリーニングによる
創薬シード化合物探索

創薬シード化合物探索基盤ユニットの役割

当ユニットは、創薬のシードおよびリード化合物の探索研究において、ハイスループットスクリーニング(HTS)によるシード化合物の発見を主務としています。また、HTSの前後のプロセスであるアッセイ系構築、アッセイ系のHTS化、HTSによって見出されたヒット化合物の評価による真のヒット化合物の確定、ヒット化合物のプロファイリングによるリード化合物候補の選定に貢献します。

創薬シード化合物探索基盤ユニットによるHTS

各創薬テーマが求めるシード化合物を探索するために、取得したい化合物像を基に、使用する材料や測定指標などを考慮した最適なアッセイ法を設定してHTSを実施する必要があります。ターゲット分子のファミリーや種類、インビトロのセルフリー系か細胞系の区別により、HTSに適した多種なアッセイ法があります(表1)。

表1 HTSに用いられるアッセイ法
Assay types In vitro biochemical assay(Cell-free) Cell-based assay Target-oriented assay Cell-based assay
Phenotypic assay
Targets Enzymes, Receptors, Protein/protein interaction, etc. GPCRs, Receptors, Ion channels, Nuclear hormone receptors, Protein/protein interactions, Signaling pathways, etc. Morphology, localization, numbers, and intensities of cells, organelles, cellular structures, and molecules
Methods Absorbance, Fluorescence Intensity, Fluorescence Polarization (FP), Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET), Time-Resolved FRET,
Alpha Screen/AlphaLISA,
Surface plasmon resonance (SPR), Microscale thermophoresis (MST), Differential Scanning Fluorimetry (DSF), Calorimetry
Reporter assay (Luciferase, SEAP etc.), Cell imaging (In cell FRET, Fluorescent proteins, Immunostaining), Yeast system, FLIPR/FDSS (Aequorin, Ca2+ sensor, other sensors), Split luciferase complementation, etc. Cell imaging (Fluorescent proteins, Organella-specific staining, Immunostaining)

当ユニットでは、図1に示すように、シングルライン/マルチチャンネル分注装置およびハイコンテントスクリーニング装置をはじめとした各種測定装置を整備しており、表1のすべてのアッセイ法によるHTSが実施可能です。また、HTSから生じる膨大なデータはデータベースによって管理しており、HTSアッセイの質を各種指標をモニターしながら実施しています(図2)。

次の画像をクリックすると拡大します

図1 創薬シード化合物探索基盤ユニットのHTS設備
図2 HTSのデータとQCの1例

創薬シード化合物探索基盤ユニットによる
ヒット化合物評価

生化学的手法やSPR解析や等温滴定型カロリメトリー解析によるターゲット分子との物理的結合解析になどによって、ヒット化合物を評価して、真のヒット化合物を同定します。また、リード化合物候補の選定を目的としたヒット化合物のプロファイリングにも貢献します。有望化合物のターゲットが未知な場合には、ケミカルゲノミックス研究グループと共同してターゲット同定を実施することが可能です。

お問い合わせ先

TOPへ