事業開発室
株式会社理研イノベーションとの連携のもと、当プログラムが推進する創薬テーマ・プロジェクトについて、企業や大学、外部研究機関との共同研究やライセンシング等のアライアンス部分を担当しています。
創薬シード化合物探索基盤ユニットハイスループットスクリーニングによる
創薬シード化合物探索
創薬シード化合物探索基盤ユニットの役割
当ユニットは、創薬のシードおよびリード化合物の探索研究において、ハイスループットスクリーニング（HTS）によるシード化合物の発見を主務としています。また、HTSの前後のプロセスであるアッセイ系構築、アッセイ系のHTS化、HTSによって見出されたヒット化合物の評価による真のヒット化合物の確定、ヒット化合物のプロファイリングによるリード化合物候補の選定に貢献します。
創薬シード化合物探索基盤ユニットによるHTS
各創薬テーマが求めるシード化合物を探索するために、取得したい化合物像を基に、使用する材料や測定指標などを考慮した最適なアッセイ法を設定してHTSを実施する必要があります。ターゲット分子のファミリーや種類、インビトロのセルフリー系か細胞系の区別により、HTSに適した多種なアッセイ法があります（表１）。
| Assay types | In vitro biochemical assay(Cell-free assay) | Cell-based assay Target-oriented assay | Cell-based assay Phenotypic assay |
|---|---|---|---|
| Targets | Enzymes, Receptors, Protein-protein interaction, etc | GPCRs, Receptors, Ion channels, Nuclear hormone receptors, Protein-protein interactions, Signaling pathways, etc | Morphology, localization, numbers, and intensities of cells, organelles, cellular structures, and molecules |
| Methods | Absorbance, Fluorescence
Intensity, Fluorescence Polarization (FP), Fluorescence Resonance Energy Transfer
(FRET), Time-Resolved FRET, Alpha Screen/AlphaLISA, Surface plasmon resonance (SPR), Microscale thermophoresis (MST), Differential Scanning Fluorimetry (DSF), Calorimetry |
Reporter assay (Luciferase, SEAP etc.), Cell imaging (In cell FRET, Fluorescent proteins, Immunostaining), Yeast system, FLIPR/FDSS (Aequorin, Ca2+ sensor, other sensors), Split luciferase complementation, etc. | Cell imaging (Fluorescent proteins, Organella-specific staining, Immunostaining) |
当ユニットでは、図1に示すように、ハイスループット分注装置、ハイコンテントスクリーニング装置をはじめとした各種マイクロプレート測定機器を整備しており、表1のすべてのアッセイ法によるHTSが実施可能です。また、HTSから生じる膨大なデータは、スクリーニングデータベースによって解析・管理しています（図２）。
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創薬シード化合物探索基盤ユニットによる
ヒット化合物評価
生化学的手法や、SPRやマイクロスケール熱泳動、等温滴定型カロリメトリー解析によるターゲット分子との物理的結合解析などを通じて、ヒット化合物を評価し、真のヒット化合物を同定します。また、リード化合物候補の選定を目的としたヒット化合物のプロファイリングにも貢献します。有望化合物のターゲットが未知な場合には、ケミカルゲノミクス研究グループや分子リガンド標的研究チームと共同してターゲット同定を実施することも可能です。
