• 計画研究 Ａ01：超伝導量子サイバネティクスの研究
• 計画研究 Ａ02：半導体ナノ集積構造による量子情報制御・観測・伝送に関する研究

• 計画研究 B01：分子スピン量子制御

• 計画研究 C01：冷却原子を用いた量子制御
• 計画研究 C02：開放型イオントラップ系による量子情報処理

• 計画研究 D01：光子量子回路による量子サイバネティクスの実現
• 計画研究 D02：光を基軸とした多キュビット量子制御

［平成24年度採択］

• 研究課題 01：Heterogeneous Quantum Repeater Hardware
• 研究課題 02：トポロジー符号化された量子計算のためのコンパイラ
• 研究課題 03：電子スピンのコヒーレント初期化の研究
• 研究課題 04：シリコン量子ビット実現に向けた要素技術の開発と関連物理の解明
• 研究課題 05：量子コヒーレント状態の制御・検出における非平衡量子統計・熱力学の理論研究
• 研究課題 06：長距離電子スピン状態転送を実現する荷電状態制御単一光子素子の研究
• 研究課題 07：光合成蛋白における生体分子スピン系の量子情報操作に向けた研究
• 研究課題 08：ダイヤモンドNV中心における量子情報の電気的制御に向けた研究

［平成22年度採択］

• 研究課題 01：量子サイバネティクスにおける量子推定理論の新たな展開
• 研究課題 02：縮退イッテルビウム原子集団を用いたクラスター量子計算の実現
  ⇒JSPS　最先端次世代開発研究プログラムに採択された理由により2011年3月末で終了
• 研究課題 03：量子ドットと超伝導体の混合量子系における量子コヒーレンス理論
• 研究課題 04：単一ＮＶ中心における多量子ビット化へ向けた研究
• 研究課題 05：異種ｇ因子２重量子ドットを用いた電子スピン・核スピン制御の研究