Laboratory for Structural Bioinformatics

タンパク質の折りたたみの原理、特にエネルギー論、を理解することで、その塩基配列からタンパク質の立体構造を予測することができる。 我々はアミノ酸の選好性を環境変数の連続関数として表示する連続的３Dプロファイル法を提案している。フーリエ級数として表現されたこの残基選好性の連続的表示は、離散的な環境クラスに遭遇すると、わずかに異なる環境での残基選好性の急激な変化を回避する。プロファイルスコアの関数形を定義することによって、原子構造がよりタンパク質の側鎖に適合する残基環境を作るように順応する原子精密化の特性を描く道を開いた。我々はこのアプローチで構造精密化、またはab initio構造予測を探求している。
タンパク質設計によって、我々は自然ではまだ観測されていないタンパク質の世界の広大な領域を探求することができる。我々は計算機によるタンパク質設計によって、単量体L型タンパク質を安定二量体に変換した。また、計算機によってL型タンパク質の新しい骨格立体構造の再設計をした。我々はタンパク質設計の原理を新型構造、新しい生物学的機能、または効果的な治療学に応用することに関心を持っている。