VoTracer Top


VoTracer    I/O    Basic Manip.    Visualization    Segmentation    Refinement    Top

# 開発者の異動に伴い、今後の開発について元所属チームと打ち合わせ中です。
# obj/stl吐き出しにバグ(出力モデルが回転してしまう)が見つかったので修正しました 2015/3/23。
# zスタックの方向が分かりにくく望まない鏡面変換が起こることがあるので、スタック方向を明示的するUIを実装しました。詳細はこちら

Abstract

VoTracer is research prototype software for volumetric image visualization and segmentation. We are distributing it for non-commercial academic use. We are not responsible for any problems caused by the software. Do not distribute.
Please contact me, if you use the software for commercial purpose. > takashi DOT ijiri80 AT gmail DOT com

VoTracerは井尻が研究のために実装している三次元画像可視化・領域分割ソフトウエアです. 教育・研究目的において,自由に使って頂いてかまいません.使用法と実装の詳細はこのページにあります。 開発者,及び,開発者所属機関は,本ソフトウエアを利用して起きた損害に関し、責任を負いません. 個別のサポートは約束できませんが,要望やバグ報告等あればお願いします.なるべく対応したいと思います。
商用利用に関してはご相談ください. > takashi DOT ijiri80 AT gmail DOT com



Requirements (動作環境)


i) Visual studio 2010 runtime 
You can download the installer from here

ii) XMedcon (only if you load Dicom files)
Download a zip file for windows, unzip, and install it.
Add the following environment variable, PATH "C:\Program Files\XMedCon\bin".
(the path depends on the folder where you installed xmedcon)



Boot (起動)

Download and unzip the latest VoTracer (zip) below.
Double clicking VoTracer.exe to boot VoTracer. You can uninstall VoTracer only by removing all unzipped files.

To use contour based refinement tool...
Download and unzip the umfpack for VoTracer (VoTracer_umfpack.zip).
Move “UmfpackDll64.dll”to the folder at which VoTracer.exe exists. UmfpackDll64.dll accelerates the refinement tool drastically.



Download

2015/3/31 VoTracer2
VoTracer_20150331 for 64bit/32bit Windows (.zip)
VoTracer umfpack (.zip)

+ add UI to specify z stack direction (スタック方向を明示するUIを実装)
+ When loading volume, select the z stack direction from the following dialog.
(画像ロード時に以下のdialogからスタック方向を指定してください。)



+ 見た目には分からないが中身は大幅に変更したので、以降名前をVoTracer2と呼ぶことにする。
+ Descending orderを選んだ場合、export tif等で出力されるvolumeもz軸反転する.
+ スタックに関する詳細な説明はこちら


2015/3/23
VoTracer_20150314 for 64bit/32bit Windows (.zip)
VoTracer umfpack (.zip)

+ メッシュ出力部分にバグを発見しました.以前のバージョンのVoTracerでは,出力メッシュに意図しない鏡面変換がかかる可能性があります.
+ このバージョンでは,メッシュ出力時に鏡面変換を入れるかどうかを選択できるようにしました.
+ これより前のバージョンは使わないことをお勧めします.

2015/3/14
VoTracer_20150314 for 64bit/32bit Windows (.zip)
VoTracer umfpack (.zip)

+ Key board input for Window level (理科大の方より要望がありました。ありがとうございました。)


2015/2/24
VoTracer_20150224 for 64bit/32bit Windows (.zip)
VoTracer umfpack (.zip)

+ Fix bugs
+ increase the accuracy of voxel pitch
+ Transparent rendering in mask ID vis mode
+ new export mode (resampling with new pitch and saving as 64 bit multi page tif)
+ (add dll 2015/2/25)

2014/2/14
VoTracer_0.321 for 64bit/32bit Windows (.zip)
VoTracer umfpack (.zip)

+ Segmentation Region Growing において『Adaptive Region growing』『背景制御点を置く機能』を削除
+ Segmentation Region Growing において制御点を『.txt』としてセーブする機能を追加
+ Segmentation Region Growing において『HSV』によるthresholdingを追加
+ umfpackDll32.dllをリンクする際にエラーがあったのでfix
+ 全体をリファクタリング and ダイアログを整理
+ 32bit版も使う方がいるようなので作成


2013/10/25
VoTracer_0.302 for 64bit Windows (.zip)
VoTracer umfpack (.zip)

+ GraphCutアルゴリズムを自分で実装 (これ以降TGraphCutDll64.dllは必要ない)
+ 平行投影モードを追加 (右上のダイアログの 『parallel proj.』チェックボックス)
+ 視点情報をsave / load 可能に


2013/4/2 update
VoTracer_0.236 for 64bit Windows (.zip)
VoTracer 高速化 & GraphCut pack (.zip)
VoTracer_0.236 for 64bit Window (理研内部用) (.zip)
+stl obj マスク画像(8bit tif)の書き出し機能追加

2013/3/18 update
VoTracer_0.234 for 64bit Windows (.zip)
VoTracer 高速化 & GraphCut pack (.zip)
VoTracer_0.234 for 64bit Window (理研内部用) (.zip)


2013/2/19 update
VoTracer_0.229 for 64bit Windows (.zip)
VoTracer 高速化 & GraphCut pack (.zip)
VoTracer_0.229 for 64bit Window (理研内部用) (.zip)


Acknowledgements (謝辞)

I appreciate following people for their comments, suggestions, bug reports on VoTracer.
+ 横浜市立大学泌尿器科 槇山先生,上野先生
+ 国立がん研究センター東病院 骨盤内外科 伊藤先生,佐藤先生
+ 理化学研究所 山村氏
+ 理化学研究所 画像情報処理研究チーム